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疫情期间不上班不算旷工，员工在疫情期间应当根据疫情防控的需要，积极参加隔离观察，目的在于避免发生感染的情况，用人单位也应当与员工配合做好相关工作，可以协商以年休假的形式来进行认定。一、疫情期间不上班算旷工吗?依据我国相法律的规定，员工在新型冠状病毒隔离期间，不能提供正常劳动的，不属于旷工，企业应当支付职工在此期间的工作报酬。根据《人力资源社会保障部办公厅关于妥善处理新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控期间劳动关系问题的通知》的相关规定：对新型冠状病毒感染的肺炎患者、疑似病人、密切接触者在其隔离治疗期间或医学观察期间以及因政府实施隔离措施或采取其他紧急措施导致不能提供正常劳动的企业职工，企业应当支付职工在此期间的工作报酬，并不得依据劳动合同法第四十条、四十一条与职工解除劳动合同。在此期间，劳动合同到期的，分别顺延至职工医疗期期满、医学观察期期满、隔离期期满或者政府采取的紧急措施结束。二、自动离职公司有权利不发所有工资吗?1、劳动法规定，劳动者为用人单位付出劳动后，就相应地有获得劳动报酬的权利。这是劳动法赋予劳动者的基本权利之一。因此，我为公司工作了，公司就必须为你支付工资，如果不支付工资，是违法的。2、而即使是自动离职，但毕竟你是为公司工作过，同样需支付你工资。公司可因自动离职作适度的工资扣减，但这必须建立在合乎程序的规章制度度之下，比如规章制度经民主程序讨论经大部分职工认可，进行公示，员工入职有进行培训并签名确认等，或者劳动合同中有约定。否则公司就不能随便扣减员工工资，因为公司没有行政处罚权。而至于扣减工资，一般不能超过20%，或扣减后所剩工资不得低于最低工资标准。国家针对疫情的防控工作出台了一系列的规定，用人单位与劳动者都应当严格遵守相关规定，并结合生产经营实际来对相关情况进行认定，特别是涉及员工因隔离不能工作的情况，是属于正常的疫情防控措施，需要支付规定标准的工资待遇。

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